Les conditions géologiques et climatiques particulières de la Réserve ont façonné des milieux naturels très variés.

Sur les 600 hectares incluant les parcelles en RNR étudiés, 509 hectares correspondent à des habitats remarquables (d’intérêt communautaire à l’échelle européenne, soit plus de 80 % du site) dont 121 hectares sont particulièrement rares et considérés comme prioritaires.

On peut y croiser :

- des landes montagnardes (216 ha)

- des landes subalpines (76 ha)

- des pelouses montagnardes et subalpines (34 ha)

- des prairies de fauche de montagne (61 ha)

- des prairies humides (4ha)

- des mégaphorbiaies, formations humides à hautes herbes (4 ha)

- des hêtraies sapinières (17 ha)

- des bois de bouleaux humides (47 ha)

- des éboulis et chaos rocheux (10 ha)

- les tourbières qui abritent une grande partie de la flore remarquable de la Réserve (40 ha)