On recense actuellement sur la RNR des Jasseries de Colleigne au moins 230 espèces de plantes à fleurs dont de nombreuses sont directement liées aux groupements tourbeux.
L’intérêt de la zone d’étude concernant la flore supérieure est exceptionnel. En effet, on compte 17 espèces rares et/ou protégées : l’ail de la victoire, l’andromède, différentes laîches (carex) des tourbières, 5 espèces de lycopodes, 2 plantes carnivores (la droséra et la grassette à grandes fleurs), le lys martagon, la canneberge…
D’autres espèces végétales, moins rares, font l’objet toutefois d’une attention particulière :
- l’arnica des montagnes (Arnica montana ) et la gentiane jaune (Gentiana lutea L.), assez abondantes sur le secteur mais dont la cueillette est réglementée dans le département de la Loire
- la knautie du Forez (Knautia foreziensis), espèce endémique des fumades du Forez. On ne la trouve qu’ici.
- 2 fougères : le polystic en lance (Polystichum lonchitis) et la doradille verte (Asplenium viride), dont il ne subsiste que de très rares stations dans le massif central.
On compte également 110 espèces de mousses sur les tourbières et landes dont 16 espèces différentes de sphaignes.